1986年初，部分第一开发部的成员脱离任天堂自立门户，在横井军平的斡旋下任天堂出资收购了IS社，IS社在FC时代先后推出《家庭大作战》（《Famicom Wars》）和《火焰之纹章》（《Fire Emblem》）两款不朽名作系列。横井军平作为IS实质的掌舵人，对于该社的管理相当宽松，在人才招募尺度上完全迥异于本社的高学历体制，FE之父加贺昭三当初只是某工业补习夜校的教师，加入IS社时已年过40。第一开发部出品游戏的总和销量虽然略逊色于情开，但其作品却以高难度深得广大核心玩家的钟爱。

1987年的初秋，一家任天堂投资的美国电脑软件公司宣布破产。在破产清算的过程中，负责人加贺昭三发现了一本布满灰尘，里面画满了条条框框示意图的业务企划书。他将这本书带回日本的他组建的当时已经成为任天堂子公司的Intelligent Systems会社。在另外两位创办人成广通与町田敏的协助下，他对这个企划书加以改进。新的企划书向任天堂本社提交，作品被命名为《火焰之纹章》。加贺昭三作为企划、导演、剧本设定者的游戏制作小组正式宣告成立。1990年4月20日，《火焰之纹章：暗黑龙与光之剑》在日本发售，在FC末期获得了近33万的销量。